114年:(醫檢)檢驗(1)
有關16S-23S rRNA internal transcribed spacer(ITS)不適用於所有細菌鑑定的原因,下列敘述何者最正確?
A有些細菌有多段不一樣的ITS序列在其genome中
B不同菌種間的ITS相似度較低
CITS建構的演化樹與16S rRNA不同
D需要用多對primers來進行PCR反應
詳細解析
本題觀念:
本題探討以16S–23S rRNA internal transcribed spacer(ITS)序列作為細菌鑑定標的時,其普適性限制。其中重點在於ITS序列於不同菌種及同一菌株不同基因座(intragenomic)之間的多樣性及變異性。
選項分析
- 選項A
有些細菌在其基因體中含有多個rrn operons,而每個operon之間的ITS序列可因重組、插入/缺失(indel)或演化壓力而互異。例如在Pseudomonas syringae與P. fluorescens,每株菌可含1至4種不同的ITS1序列;而Acinetobacter bereziniae、A. guillouiae、A. baylyi亦各自擁有多段長度與序列不相同的ITS,直接影響鑑定結果的一致性與可重複性 (pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)。 - 選項B
ITS變異度高,正是其用於細菌種間鑑別的優點;若不同菌種間ITS相似度低,實際上能提高分類解析度,並非「不適用」的主要原因。 - 選項C
ITS所構建的演化樹與16S rRNA的分支次序有差異,但這種差異多因序列變異速率不同所致,並
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