針對單一核苷酸多型性（ single nucleotide polymorphism, SNP ）或單一核苷酸變異（ single nucleotide variation, SNV ）晶片的臨床檢驗應用，下列敘述何者最不適當？

本題觀念：

單一核苷酸多型性（SNP）或單一核苷酸變異（SNV）晶片主要是針對已知的變異位點進行高通量定量偵測，廣泛應用於遺傳易感性評估、藥物基因體（pharmacogenomics）、基因分型及病原體抗藥性基因檢測，但無法用於發現未知的新變異（novel variant）。

選項分析

• 選項A 可用於已知 HLA相關藥物基因體檢測
  SNP晶片可藉由標記(tagging)特定HLA等位基因上的代表性SNP來預測HLA基因型，進而評估藥物不良反應風險。例如：rs10484555上的C等位基因可100%標示HLA-B15:02；rs9262570上的T等位基因可100%標示HLA-B58:01。這種基於已知SNP的HLA分型技術已在臨床試驗及移植實務中被驗證為高靈敏度與高特異性(pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)，故此項敘述適當。

• 選項B 可以檢驗受試者具有特定疾病的發生風險
  SNP晶片廣泛用於基因體定序前導之全基因定址分析(GWAS)，可偵測與特定複雜疾病（如類風溼性關節炎、前列腺癌）相關的多個風險SNP位點，以評估個人疾病傾向與易感性(en.wikipedia.org)，因此本敘述正確。

• 選項C 可用於抗藥性病原體的檢驗
  雖然此處所稱“SNP晶片”多指人類基因體晶片，但同理微陣列技術亦可設計探針偵測病原體已知的抗藥性基因或抗藥性相關SNP。例如，研究已利用寬頻微陣列同時檢測多種細菌耐藥基因（共94個基因）、並對Acinetobacter baumannii之91個抗藥性序列進行快速鑑定，敏感度與特異度均超過90%(pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)。故本敘述無誤。

• 選項D 可以篩檢新穎（novel）單一核苷酸變異位點
  SNP/SNV晶片所用之探針為針對先前已知、經文獻或資料庫確認的變異序列所設計；因此無法偵測陣列中未收錄的未知（novel）變異。換言之，晶片只能定量已知SNP，無法發現新變異位點(en.wikipedia.org)，本項敘述最不適合。

答案解析

SNP/SNV晶片的核心限制在於“只能偵測已知變異而非新變異”。A、B、C三項皆屬於已知應用範疇：A利用標記SNP進行HLA藥物基因體分型，B透過GWAS SNP評估疾病易感，C亦可設計探針偵測病原體耐藥SNP或基因。而D項主張可篩檢novel變異，與技術特性相違，故最不適當，為正解。

核心知識點

1. SNP/SNV陣列探針設計：

   • 探針來源於已知SNP位點（dbSNP、1000 Genomes等）；
   • 雙探針策略（wild-type與variant）以區分等位基因；
   • 無法解析未收錄之新變異。

2. 臨床應用：

   • Pharmacogenomics：HLA-B15:02、B58:01等藥物不良反應風險基因型；
   • 疾病易感性：GWAS標定之複雜疾病風險SNP套組；
   • 病原體抗藥性：微陣列偵測已知抗藥基因(SNP或基因型)；
   • 腫瘤基因體：LOH、copy-number變異、uniparental disomy等。

3. 技術限制：

   • 無法發現novel變異；
   • 雜交效率與背景雜訊影響；
   • 偽陽性與假陰性需以其他方法（NGS、Sanger）確認。

臨床重要性

瞭解SNP/SNV晶片技術特性有助臨床醫師及實驗室科學家：

• 精準選藥（drug selection）與預防嚴重不良反應；
• 個人化風險評估及健康管理；
• 實驗室檢測策略規劃：何時以陣列，何時以NGS。