微陣列比較型基因組雜交（ array comparative genomic hybridization, aCGH ）晶片分析是目前臨床用於進行基因體檢測的工具之一；關於 aCGH的敘述，下列何者最正確？

本題觀念：

本題探討 array comparative genomic hybridization（aCGH）的原理與臨床應用，重點在於理解 aCGH 主要偵測基因組拷貝數變異（copy number variation, CNV）的特性及其限制。

選項分析

• 選項A
  aCGH 採用的是患者與參考基因組的基因體 DNA 進行螢光標記與混合雜交，並非以訊息 RNA（mRNA）做為分析標的。其流程中並無逆轉錄或 cDNA 合成等步驟，不適合測量基因表現量（expression profiling）(pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)，故此選項錯誤。

• 選項B
  aCGH 利用微陣列探針對全基因組 DNA 進行競爭性雜交，可在全基因組範圍內以 100 kb 至幾 Mb 的解析度偵測缺失或重複等長片段拷貝數變異，並可將變異區段定位至已知的基因或染色體區域(en.wikipedia.org)，此敘述正確。

• 選項C
  aCGH 的解析度受限於探針間距及訊號強度，無法精確偵測單核苷酸等級的變異（point mutation）。此類序列變異須依賴定序（sequencing）或 SNP 分型陣列等技術才能偵測(genomics.nshcs.org.uk)，故此選項錯誤。

• 選項D
  比較單一核苷酸多型性（SNP）差異需使用專門的 SNP 陣列（SNP array），而 aCGH 探針並非設計以檢測不同等位基因，因此無法用來比較家族間的 SNP 差異(genomicseducation.hee.nhs.uk)，此選項錯誤。

答案解析

aCGH 是一種以競爭性雜交原理為基礎的分子細胞遺傳技術，專門偵測基因體層次的拷貝數變異。在臨床上常用於先天性異常、發展遲緩、自閉症等患者，以及腫瘤樣本的基因組異常分析。其優勢在於解析度高、可同時掃描全基因組拷貝數的增減；但無法偵測表達量（mRNA）、單核苷酸級別突變或平衡性染色體重排（translocation/inversion）。綜合上述，選項B 最符合 aCGH 的功能和應用範圍。

核心知識點

• aCGH 原理：以患者與參考基因組 DNA 分別標記螢光，競爭性雜交至含有已知位置探針的微陣列，量化紅/綠螢光訊號比值以偵測 CNV。
• 應用：高解析度檢測全基因組缺失／重複（100 kb 至幾 Mb），臨床用於先天基因體畸變篩檢、腫瘤基因組異常分析、產前診斷等。
• 限制：
  1. 無法測量基因表現量（非 mRNA 分析技術）。
  2. 無法偵測點突變或序列層次變異（需 sequencing）。
  3. 無法比較 SNP 差異（需 SNP array）。
  4. 無法識別平衡性染色體重排及低度嵌合性（mosaicism）有限。

臨床重要性

aCGH 已成為遺傳性疾病和腫瘤基因體檢測的常規工具，具有高靈敏度與高解析度。理解其適應症及限制，可協助臨床醫師選擇合適的基因組檢測方法並正確解讀報告。