以次世代定序進行遺傳基因檢測，利用已知變異的參考物質，計算可偵測範圍中的每種變異的準確度，整理檢測結果如圖所示。下列計算何者正確？

本題觀念：

此題核心在於從混淆矩陣(confusion matrix)推導各種診斷測試性能指標，包括敏感度(sensitivity)、特異度(specificity)、陽性預測值(PPV)、陰性預測值(NPV)、偽陽性率(FPR)、偽陰性率(FNR)以及正向/負向一致率(PPA/NPA)。題幹額外加入「無偵測(no calls)」欄位，考生須理解何者納入分母、何者排除，才能正確套用公式。

影像分析：

表格各象限含義如下

• 真陽性(TP)=A：檢測陽性且參考試驗陽性
• 假陽性(FP)=B：檢測陽性但參考試驗陰性
• 假陰性(FN)=C：檢測陰性但參考試驗陽性
• 真陰性(TN)=D：檢測陰性且參考試驗陰性
• 無效偵測對陽性參考=E，對陰性參考=F
• 各行列合計亦標示於表格，總樣本數 N=A+B+C+D+E+F

此混淆矩陣特別加入「無偵測／無效偵測」類別，提示有些指標計算時需排除此類結果。

選項分析

• 選項A 陽性一致率： A/(A+C+E)
  PPA(Positive Percent Agreement)標準公式為A/(A+C)，排除無效呼叫(E) ([ncss.com](https://www.ncss.com/software/ncss/diagnostic-tests-in-ncss/?utm_sourc

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