114年:(醫檢)檢驗(2)

利用標的擴增( amplification )技術進行病毒分子檢測時,下列何組病毒與偵測標的基因的配對最適當?

AHCV:nucleoprotein gene
Binfluenza virus :conserved matrix gene
CSARS-CoV-2:DNA polymerase gene
DBK virus (polyomavirus ):fusion gene

詳細解析

本題觀念:

本題聚焦於分子檢測中,利用標的基因(target gene)擴增(PCR/RT-PCR)做病毒診斷時,應選擇高度保守且代表性強的基因區段,以兼顧檢測的敏感度與廣泛性。

選項分析

  • 選項A HCV:nucleoprotein gene
    HCV屬於Flavivirus科,人類C型肝炎病毒基因組長約9.6 kb,包含5′UTR、單一長開放閱讀框(ORF)及3′UTR,結構蛋白為Core(C)、E1、E2、p7,非結構蛋白為NS2~NS5B,並無標稱「nucleoprotein gene」。臨床RT-PCR常以5′UTR(高度保守)或NS5B區段為檢測標的,而非 nucleoprotein(pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)。

  • 選項B influenza virus:conserved matrix gene
    Influenza A病毒基因組分為8段,Matrix (M) segment高度保守,廣泛應用於通用型RT-PCR篩檢以偵測所有亞型;多數FDA/CDC核准方法即以M基因為主標的,用於快速、敏感的全株偵測(pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)。

  • 選項C SARS-CoV-2:DNA polymerase gene
    SARS-CoV-2為單股正義RNA病毒,無DNA聚合酶基因(DNA polymerase)。常見PCR標的為N基因(nucleocapsid)、E基因(envelope)或RdRp(RNA-dependent RNA polymerase,位於ORF1ab),並非DNA polymerase(wwwnc.cdc.gov)。

  • 選項D BK virus(polyomavirus):fusion gene
    BK virus屬小DNA病毒(Polyomavirus),基因組無膜融合蛋白(fusion protein),fusion gene見於Paramyxoviridae等包膜病毒。Polyomavirus檢測常以VP1/VP2(構造蛋白基因)或large T antigen區段為標的(pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)。

答案解析

Influenza A通用偵測需涵蓋所有亞型,M基因序列在不同亞型間保存度最高,適合做PCR引子設計;本題其他選項所列標的基因均與該病毒基因組結構或檢測慣例不符,只有選項B最妥當。

核心知識點

  • 病毒基因組結構與常用分子檢測標的
    • HCV:5′UTR、NS5B區段(非nucleoprotein)
    • Influenza A:conserved M gene
    • SARS-CoV-2:N、E或RdRp區段(非DNA polymerase)
    • Polyomavirus:VP1/VP2或large T antigen(無fusion gene)

  • 分子檢測設計要點
    • 標的基因需高度保守,避免偵測不到新變種
    • 盡量選擇全病毒亞型通用區段以提高廣泛性
    • 留意病毒是否具有該基因或蛋白才能作為標的

臨床重要性

適當的標的基因選擇可確保分子診斷的敏感度與廣泛性,降低偽陰性風險,對於公共衛生監測及臨床診斷極為關鍵。