113年:(醫檢)檢驗(2)

下列那一個分子檢驗技術最適合評估與檢測腫瘤突變負荷(tumor mutation burden)?

A桑格定序法(Sanger sequencing)
B即時定量聚合酶連鎖反應(real-time qPCR)
C次世代定序(next-generation sequencing, NGS)
D數位化聚合酶連鎖反應(digital PCR)

詳細解析

本題觀念:

腫瘤突變負荷(tumor mutation burden, TMB)是單位基因組(通常以 Mb 計)中非同源突變數量,與免疫檢查點抑制劑治療反應密切相關。評估 TMB 需要同時檢測大量基因的突變,以統計整體突變數目;此項目對序列深度、覆蓋範圍及通量要求高。

選項分析

  • 選項A 桑格定序法(Sanger sequencing)
    桑格定序適用於單一或少數基因序列的精確定序,通量低、成本高,無法在合理時間內同時偵測或統計上千~上萬個基因區域的突變。研究顯示,Sanger 對於低於 15% 突變等位基因頻率的變異無法檢出,且不具大規模並行能力,故不適用於 TMB 評估(pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)。

  • 選項B 即時定量聚合酶連鎖反應(real-time qPCR)
    qPCR 需針對已知突變設計探針,只能定量特定基因或熱點突變,無法進行大範圍、假設自由(hypothesis-free)的全基因組或全外顯子測序。其通量及覆蓋範圍受限,不適用於統計全外顯子或大面積基因面板的總突變數目([illumina.com](https://www.illumina.com/science/technology/

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