113年:(醫檢)微生(2)

利用分子生物技術來進行真菌的分類,最主要的診斷標記是下列何者?

Aprotein胺基酸序列
Bmitochondria DNA序列
C16S rRNA基因序列
Dinternal transcribed spacers(ITS)基因序列

詳細解析

本題觀念:

本題探討利用分子生物技術進行真菌分類時,選用何種基因區域作為「通用 DNA 條碼(DNA barcode)」最能提供廣泛適用性及物種解析度。真菌領域已由多實驗室、跨國研究證實,核糖體 DNA 的 Internal Transcribed Spacer(ITS)區域,因為高 PCR 擴增成功率、在種內種間差異明顯的「條碼間隙(barcode gap)」及已有大量序列資料庫支援,而被正式採納為真菌的主要 DNA 條碼標記。

選項分析

  • 選項A:protein胺基酸序列
    雖然如 RPB1、RPB2 及 MCM7 等單拷貝蛋白質編碼基因在部分分類與親緣分析具優勢,但普遍面臨 PCR 擴增困難及引子設計受限,導致序列獲得率低、標準化及普適性不足,故無法作為涵蓋整個真菌界的通用條碼候選區域 citeturn2search0。

  • 選項B:mitochondria DNA序列
    動物常用的 CO1 區段在真菌中因為含大量內含子或模板結構複雜,PCR 擴增成功率差,同時缺乏與物種間演化距離的明確關聯性。多篇研究均顯示,各真菌界支系的線粒體基因雖有分支解析能力,但難以普遍適用且未優於 ITS 區域 citeturn2search0turn1search1。

  • 選項C:16S rRNA基因序列
    16S rRNA 為細菌及古菌的標

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