113年:(醫檢)免疫病毒(2)

PCR腸病毒檢測的primer最主要設計在病毒基因的那個區域?

A5' UTR
B3' UTR
C3D RdRp
D3C protease

詳細解析

本題觀念:

PCR 檢測腸病毒時,primer 必須設計在高度保守的基因區段,以確保能廣泛偵測各血清型。腸病毒基因組的 5′ UTR 區域含有 type I IRES(internal ribosome entry site),序列長度約 700–750 nt,結構穩定且在所有腸病毒中保守度最高,故為泛腸病毒 RT-PCR 檢測最常使用的 primer 設計位置。

選項分析

  • 選項 A 5′ UTR
    腸病毒 RT-PCR primer 設計最常針對的區段,即 IRES 第五結構域中高度保守序列,用於泛腸病毒檢測,靈敏度與廣譜性佳。多篇文獻以 5′ UTR 作為檢測 primer 及探針設計基礎,確認能涵蓋所有主要腸病毒血清型。(journals.asm.org)

  • 選項 B 3′ UTR
    雖同屬非編碼區,但 3′ UTR 在腸病毒間變異度相對較高且長度及二級結構差異大,不利於泛用 primer 設計,文獻中極少用於臨床檢測。

  • 選項 C 3D RdRp
    3D 基因(RNA-dependent RNA polymerase)屬編碼區,保守度雖高,但相對 5′ UT

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