由全轉錄體定序（whole transcriptome sequencing）產出用於敘述各個基因產物豐度的 fragments per kilobase of transcript per million mapped reads（FPKM）值，最不會受到下列那個因子的影響？

本題觀念：

本題核心在於理解 FPKM（Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads）這種 RNA-Seq 定量指標的計算方式與適用範圍。FPKM 同時考量了基因／轉錄本長度以及總 mapped reads（測序深度）的影響，以便在同一樣本或不同樣本之間比較各基因的相對表現量。

選項分析

• 選項 A：定序基因產物的長度
  FPKM 分母有一個 L（基因或轉錄本長度，以 kb 為單位），公式 FPKM = RM_g × 10^9 ／ (RM_t × L) 明確顯示長度會影響結果，長度越長、同樣讀數下 FPKM 越小。故此選項錯誤。 (docs.gdc.cancer.gov)

• 選項 B：可正確比對至定序基因產物的讀長數（mapped reads）
  FPKM 的分子 RM_g 即是該基因／轉錄本的 mapped reads 數量（或 fragment 數），mapping 數越多、同樣其他條件下 FPKM 越大。顯然受此因子影響，故此選項錯誤。 ([docs.gdc.cancer.gov](https://docs.gdc

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