113年:(醫檢)檢驗(1)

胺基酸序列Val-Leu-Iso-Arg-Ile-Gly-Gly-Lys-Tyr-Ala-Phe-Ala-Val-Asp-Glu-Lys-His-Arg,經 trypsin水解後,可產生幾個小胜肽片段?

A2
B3
C4
D5

詳細解析

本題觀念:

瞭解Protease的切割特異性與胺基酸序列中切割位點的位置,並依此計算產生之胜肽(peptide fragment)數量。本題重點在於trypsin專一性:從Lys(K)或Arg(R)殘基的羧基端切開肽鍵,但若下一位(P1’)為Pro(P)則阻斷切割。

選項分析

首先將序列以一字母代號標示並編號: 1 V 2 L 3 I 4 R 5 I 6 G 7 G 8 K 9 Y 10 A 11 F 12 A 13 V 14 D 15 E 16 K 17 H 18 R

Trypsin切割規則:

  • 切在R、K的C端,若P1’(下一位)為Pro則不切(web.expasy.org)(sigmaaldrich.com)。
  • 本序列中無Pro緊鄰於任何R或K,因此所有R/K皆為可切位。

可切位點:

  • 第4位 Arg 後(下一位為 Ile, 非Pro)
  • 第8位 L

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