112年:(醫檢)檢驗(2)
下列何者最適用於發現 DNA 具有未知的點突變（ point mutation ）或短小的鹼基對插入／刪除（ small insertion/ deletion）？
A化學切割錯誤的鹼基法（ chemical cleavage of mismatch duplexes, CCM ）
B增幅阻礙突變系統（ amplification refractory mutation system, ARMS ）
C等位基因特異性寡核苷酸雜交（ allele-specific oligonucleotide hybridization, ASO ）
D增幅限制酶切位點（ amplified created restriction sites, ACRS ）
詳細解析
本題觀念
本題聚焦於「基因突變掃描（mutation scanning）」與「已知突變偵測（allele‐specific detection）」的比較。前者須能在未知序列背景下全域搜尋各類點突變或小型插入／刪除；後者則需針對特定位點或已知變異設計專一性探針或引子。
選項分析
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選項A 化學切割錯誤的鹼基法（CCM）
CCM 將 PCR 產物與野生型序列形成雜交體，再分別用 hydroxylamine（修飾錯配的 C）及 KMnO₄（修飾錯配的 T）處理，piperidine 則在修飾位點切斷骨架。完成後以電泳分離片段，即可定位並初步鑑定未知的點突變或 small indels。該法可同時掃描長度可達 1–2 kb 的 amplicon，對所有可能的單核苷酸取代及小型插入／刪除均具高敏感度，無須事先知道突變類型或序列位置(pubmed.ncbi.nlm.nih.gov)。 -
選項B 增幅阻礙突變系統（ARMS）
ARMS（又稱 allele-specific PCR）利用 3′ 末端與突變位點完全互補或故意不互補的引子，僅當模板含指定等位基因時才能有效延伸，透過有無 PCR 產物判斷基因型。此法只能偵測「已知」
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