112年:(醫檢)檢驗(2)
醫學檢驗室選擇使用高通量基因定序進行細菌分型鑑定時，下列敘述何者最正確？
A短片段基因定序產生的通量大於長片段基因定序，因此細菌分型只能使用短片段定序法
B細菌基因序列具有高 GC 比的特性，因此不建議使用高通量基因定序進行細菌分型
C短片段基因定序可以完成 100% 的細菌全基因組序列組裝（ assembly ）
D單分子即時定序法（ single molecule real-time sequencing ）不受細菌基因組中的高 GC 比區域的影響
詳細解析
本題觀念：
細菌分型鑑定時，實驗室常用高通量基因定序（High-Throughput Sequencing, HTS）技術，需考量定序平台的讀長（read length）、通量（throughput）、GC 含量偏好（GC-bias）及組裝（assembly）能力等特性。
選項分析
- 選項A
「短片段基因定序產生的通量大於長片段基因定序，因此細菌分型只能使用短片段定序法」
• 短片段（short-read）平台（如 Illumina）確實具有更高通量，可產生上百萬至上千萬條短序列讀段；長片段（long-read）平台（如 PacBio SMRT、Oxford Nanopore）每次產出讀段數量較少，通量較低 (aatbio.com)。
• 但細菌全基因組分型不僅仰賴通量，還須解決重複序列與結構變異的辨識，長片段序列在基因組組裝與複雜結構變異偵測方面更具優勢，因此不會「只能使用短片段定序」；此選
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