111年:(醫檢)血液(2)
下列何種檢測方式無法鑑別國人 B3表現型之所有已知基因型?
AAllele-specific oligonucleotide hybridization
BAllele-specific PCR
CSequencing
DcDNA microarray
詳細解析
本題觀念:
ABO血型B3亞型的分子基礎及分子檢測策略。B3亞型常見於台灣族群,主因是ABO基因第3內含子5′剪接位點突變(IVS3+5G→A),亦可見247G→T(Asp83Tyr)及少數其他外顯子或啟動子區位點變異,造成B抗原表現減弱與外觀混合沈降現象。正確鑑別所有已知B3基因型需偵測多個不同核苷酸位點,檢測方法應能涵蓋外顯子、內含子及調控序列變異。
選項分析
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選項A Allele-specific oligonucleotide hybridization
以已知變異位點設計完全互補(perfect‐match)與單鹼基不配對(mismatch)短探針,於微陣列表面與樣本DNA雜交,可針對IVS3+5G>A、247G>T、259G>T及-68G>T等已知SNP設計探針,藉強制洗脫條件(stringent wash)區分各等位基因,理論上可同時覆蓋所有已報導B3變異位點(ncbi.nlm.nih.gov)。 -
選項B Allele-specific PCR
採用專一引子於3′端辨識單一核苷酸差異,對每一個目標SNP設計不同的等位基因特異性引子,經PCR擴增後以電泳或即時螢光定量
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