下列何種基因之基因定序比對，最不適用於細菌菌種鑑定？

本題觀念：

細菌菌種鑑定常倚賴分子分型，包括保守度高具種間分辨力的16S rRNA基因、位於16S與23S rRNA基因之間的ITS(intergenic spacer)，以及housekeeping基因如recA等。5.8S rRNA基因則屬於真核生物rRNA cluster（18S-5.8S-28S），並非原核生物rRNA operon之組成，因此不適合用於細菌鑑定。

選項分析

• 選項A 16S rRNA
  廣泛作為細菌分類與種鑑定的金標準，因其序列含保守區與多樣變異區，能辨識門、屬、種等層級，適用於絕大多數細菌(onlinelibrary.wiley.com)。

• 選項B 16S-23S rRNA ITS
  位於16S與23S rRNA基因間的intergenic spacer，序列與長度變異度高，用於進一步區分親緣接近的菌種，如環境與臨床分離株剖析時常見citeturn0search6。

• 選項C recA
  recA為DNA修復/重組housekeeping基因，序列差異度通常優於16S rRNA，可補足16S

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