未知真菌菌株的分子鑑定，下列何種方法正確性高？

本題觀念：

本題在探討利用分子生物學方法鑑定未知真菌菌株，核心在於選擇何種核糖體基因區段定序，才能在真菌間獲得高正確性（species-level）之鑑定。

選項分析

• 選項A 16S rDNA定序
  16S rDNA為原核生物（細菌及古菌）小次單位（SSU）核糖體基因，可做為細菌之通用條碼（barcode），並不適用於真菌，因為真菌不具有16S rRNA基因。citeturn3search5

• 選項B 18S rDNA定序
  真菌的18S rDNA（等同SSU）雖屬於真核生物通用分子標的，可鑑別門或綱階層，卻保守性高，無法呈現足夠物種間變異，故在species-level鑑定靈敏度不佳。已有研究顯示，與18S rDNA相比，內部轉錄間隔區（ITS）能提供較高多樣性與物種特異指紋。citeturn2view0

• 選項C 5.8S rDNA定序
  5.8S rDNA位於ITS1與ITS2之間，長度僅約160–180 bp，且因為編碼ribosomal RNA結構而高度保守，其序列變異極小，不足以用於物種鑑定；常作為ITS定序之內部引子結合區，並非鑑別標的。citeturn1view0

• 選項D Internal transcribed spacer（ITS）定序
  ITS區域（包括ITS1、5.8S及ITS2）

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