111年:(醫檢)檢驗(1)
未知真菌菌株的分子鑑定,下列何種方法正確性高?
A16S rDNA定序
B18S rDNA定序
C5.8S rDNA定序
DInternal transcribed spacer ( ITS )定序
詳細解析
本題觀念:
真菌的分子鑑定依賴核糖體 DNA(rDNA)不同區段的序列分析。細菌鑑定常用 16S rDNA,而真菌則因演化差異,有其專屬的最佳標記基因。本題考核各 rDNA 區段用於真菌鑑定的準確性高低。
選項分析
(A) 16S rDNA 定序 不適合。16S rDNA 是原核生物(細菌)的核糖體小次單元基因,真菌為真核生物,對應的區段為 18S rDNA;使用 16S 引子無法有效擴增真菌 DNA,鑑定準確性極低。
(B) 18S rDNA 定序 可用但準確性較 ITS 低。18S rDNA(核糖體小次單元,SSU)在真菌中保守性過高,物種間序列差異小,對近緣菌種(species level)的解析度不如 ITS;適合較高分類階層(屬以上)的親緣分析,但種內鑑別能力有限。
(C) 5.8S rDNA 定序 不適合。5.8S rDNA 為 rDNA 轉錄單元中極短且高度保守的區段(約 160 bp),物種間序列幾乎相同,無法用來區分不同真菌物種。
(D) Internal transcribed spacer(ITS)定序 ✅ 正確,準確性最高。ITS 區域位於 18S–5.8S–28S rDNA 之間(ITS1 介於 18S 與 5.8S,ITS2 介於 5.8S 與 28S),屬非編碼轉錄
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