113年:營養生理生化(1)
Footprinting或DNase protection的分析方法常被應用於判斷下列何種狀況？
A突變所造成受損DNA的區域
B染色體上特定基因的位置
C單股DNA分子上內生性雙股區域的位置
D特定蛋白質（例如repressor、polymerase等）與DNA的結合狀況
詳細解析
本題觀念：
本題考查的是分子生物學中用於分析 DNA-蛋白質交互作用 (DNA-protein interaction) 的核心技術——DNA足跡法 (DNA footprinting)，又稱為 DNase保護分析法 (DNase protection assay)。
此技術的基本原理是：當一個特定的蛋白質（如轉錄因子、聚合酶、Repressor等）結合在DNA的特定序列上時，該蛋白質會保護結合部位的DNA，使其免受酵素（如 DNase I）的切割。在凝膠電泳分析中，未被切割的區域會形成一段空白，看起來像是一個「腳印 (footprint)」，藉此可精確定位蛋白質在DNA上的結合位置。
選項分析
-
A. 突變所造成受損DNA的區域：錯誤。
- 偵測突變或DNA受損通常使用定序 (Sequencing)、Ames test (突變性測試)、Comet assay (彗星分析法，測DNA斷裂) 或錯配切割分析 (Mismatch cleavage) 等技術。
- 雖然突變可能會影響蛋白質的結合，導致足跡消失或改變，但足跡法本身的設計目的是為了看「蛋白質結合在哪裡」，而非直接檢測受損區域。
-
B. 染色體上特定基因的位置：錯誤。
- 定位染色體上特定基因
...（解析預覽）...