104年:營養生理生化(1)

兩個多肽,其序列分別為: Ala-Met-Ala-Leu-Gly-Arg-Tyr-Glu-Gly-Ile 以及Ala-Gly-Leu-Ala-Met-Arg-Ile-Gly-Glu-Tyr ,下列方法何者可以區分此二序列?

A使用酸進行水解,之後再分析胺基酸組成
B使用 Sanger's reagent 進行反應,之後再分析產物
C使用 trypsin進行水解,之後再分析各產物之胺基酸組成
D使用 carboxypeptidase 進行水解,之後再分析產物

詳細解析

本題觀念:

本題考查蛋白質定序(protein sequencing)的各種方法,以及如何區分兩條胺基酸組成相同但序列不同的多肽。核心在於理解各方法所能提供的資訊層次:是僅知道「有哪些胺基酸」還是「胺基酸的排列順序」。

兩條多肽序列為:

  • 多肽一:Ala-Met-Ala-Leu-Gly-Arg-Tyr-Glu-Gly-Ile
  • 多肽二:Ala-Gly-Leu-Ala-Met-Arg-Ile-Gly-Glu-Tyr

兩者胺基酸組成完全相同(都含 2×Ala、1×Met、1×Leu、2×Gly、1×Arg、1×Tyr、1×Glu、1×Ile),但排列順序不同。

選項分析

(A) 使用酸進行水解,之後再分析胺基酸組成 酸水解(如 6N HCl)將多肽完全水解為個別胺基酸,然後進行胺基酸組成分析(amino acid composition analysis)。由於兩條多肽的胺基酸組成完全相同,此方法無法區分兩者。

(B) 使用 Sanger's reagent 進行反應,之後再分析產物 Sanger's reagent(FDNB,1-fluoro-2,4-dinitrobenzene)與多肽 N 端胺基酸的自由胺基(free amino group)共價結合,再經酸水解後產生 DNP-胺基酸衍生物,可鑑

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